Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ARID5AQ03989 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms