Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CLTCQ00610 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLTCQ00610 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC109479.3-201ENST00000520163 360 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC130456.3-201ENST00000561762 633 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CLTCQ00610 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms