Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
HOXC5Q00444 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
HOXC5Q00444 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms