Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SPOCK3-207ENST00000504953 2900 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 WDR60-202ENST00000407559 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 INIP-203ENST00000374242 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CBX1P83916 DNMT3B-206ENST00000456297 2315 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C9orf106-201ENST00000316786 3145 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 FAM78A-203ENST00000372271 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AL021155.1-201ENST00000438808 2637 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CBX1P83916 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
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