Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 JADE1-209ENST00000511647 3560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IRX1P78414 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRX1P78414 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 C21orf62-AS1-201ENST00000382375 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRX1P78414 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRX1P78414 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRX1P78414 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms