Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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FAM3BP58499 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FAM3BP58499 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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