Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THOP1P52888 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THOP1P52888 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms