Protein–RNA interactions for Protein: P52306

RAP1GDS1, Rap1 GTPase-GDP dissociation stimulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1GDS1P52306 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RAP1GDS1P52306 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RAP1GDS1P52306 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms