Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FDFT1P37268 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms