Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms