Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PSMB4P28070 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms