Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN3P26045 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms