Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ITGA6P23229 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms