Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TCP1P17987 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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