Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GM2AP17900 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GM2AP17900 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms