Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ARAP1-204ENST00000393609 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 STARD8-203ENST00000374599 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PDE12-201ENST00000311180 8773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TNNI1-207ENST00000622580 6142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 RNF111-201ENST00000348370 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 DENND3-221ENST00000523308 2959 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 HSPA12A-201ENST00000369209 5722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
IFITM1P13164 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms