Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SEC24DO94855 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms