Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
COCHO43405 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
COCHO43405 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms