Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ERVV-2B6SEH9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ERVV-2B6SEH9 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms