Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms