Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TMEM18-201ENST00000281017 2762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 NEK11-209ENST00000510688 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LINC00587B1AMM8 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ISM2-202ENST00000342219 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HECW1-IT1-201ENST00000322220 1839 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MAN2C1-201ENST00000267978 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 WFS1-202ENST00000503569 3255 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MLF1-209ENST00000482628 1050 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CYP4F12-215ENST00000550308 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SPART-203ENST00000451493 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC092028.1-202ENST00000641483 3547 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC092028.1-201ENST00000641781 3540 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AIPL1-201ENST00000250087 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CLEC4F-201ENST00000272367 2475 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SIGLEC11-203ENST00000447370 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF384-204ENST00000396801 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RFWD3-202ENST00000571750 3033 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 RGS9-203ENST00000449996 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
LINC00587B1AMM8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms