Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SLC38A1-202ENST00000439706 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 SETD4-207ENST00000399215 4272 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DNAJA4-201ENST00000343789 2961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GMFB-201ENST00000358056 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VGLL3A8MV65 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CACNA1G-220ENST00000507896 6600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MAX-212ENST00000555932 1673 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ABL2-210ENST00000511413 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LINC00894-206ENST00000450989 2361 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TMPRSS3-201ENST00000291532 3193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VGLL3A8MV65 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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VGLL3A8MV65 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CR2-202ENST00000367058 4063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC135050.1-201ENST00000622229 3380 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 ST5-256ENST00000534127 4545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
VGLL3A8MV65 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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