Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC169A6NNP5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms