Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 C11orf45-202ENST00000524878 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RGPD3A6NKT7 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms