Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC78A2IDD5 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms