Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ERVW-1Q9UQF0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms