Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
AFF4Q9UHB7 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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