Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TFIP11Q9UBB9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms