Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CXXC1Q9P0U4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CXXC1Q9P0U4 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms