Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
MIS18AQ9NYP9 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MIS18AQ9NYP9 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms