Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms