Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ASCL3Q9NQ33 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms