Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NXF3Q9H4D5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NXF3Q9H4D5 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms