Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PI4K2AQ9BTU6 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms