Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 MRPL18-201ENST00000367034 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT17Q9BSW7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 GYG2-201ENST00000353656 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT17Q9BSW7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms