Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TMEM175Q9BSA9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TMEM175Q9BSA9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms