Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
FYCO1Q9BQS8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms