Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 POMGNT1-203ENST00000396420 3480 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ALAS1-201ENST00000310271 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ABCC4-206ENST00000536256 2840 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 GCN1-201ENST00000300648 8675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SORL1-206ENST00000527934 3032 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LRRN2-202ENST00000367176 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KIAA1644-201ENST00000381176 6751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 DNAJC3-202ENST00000602402 5591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MUC4-203ENST00000346145 3982 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MYO5B-201ENST00000285039 9505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 STAT3-213ENST00000588969 2772 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TRAF3IP2-208ENST00000392556 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PLAGL2-201ENST00000246229 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FHOD3-202ENST00000359247 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FLNB-204ENST00000429972 9430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 IGSF9B-201ENST00000321016 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LINC01446-201ENST00000380970 3484 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NFIB-206ENST00000397575 2869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TSNAX-201ENST00000366639 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CLDN4-203ENST00000435050 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PLXNA4-202ENST00000359827 13786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ARNT2-201ENST00000303329 6558 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PTCD2-212ENST00000543322 2029 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 F7-206ENST00000541084 2873 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 JAK1-201ENST00000342505 5047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LRRC41-207ENST00000617190 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MARCH5-201ENST00000358935 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 XIRP1-202ENST00000396251 6040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TNIK-206ENST00000460047 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AP000350.6-201ENST00000609510 5637 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 SLC4A1AP-201ENST00000326019 2959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 HNRNPF-203ENST00000357065 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ASIC1-208ENST00000552438 3327 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PCDHA4-202ENST00000512229 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZFYVE28-206ENST00000508471 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MTR-202ENST00000366577 10529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KCNAB2-204ENST00000378083 4142 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PIWIL2-202ENST00000454009 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 HNRNPH2-201ENST00000316594 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 KBTBD4-209ENST00000533290 3079 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF446-205ENST00000596341 3922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CPEB3-202ENST00000412050 7664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 EHD2-201ENST00000263277 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CYTH4-201ENST00000248901 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ZNF682-203ENST00000397165 3245 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PKP1-201ENST00000263946 5447 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 C16orf62-203ENST00000438132 3855 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 ICOS-202ENST00000435193 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PRAC1Q96KF2 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms