Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC97Q96F63 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms