Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NMD3Q96D46 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms