Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NEIL2Q969S2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms