Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TOPBP1Q92547 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TOPBP1Q92547 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms