Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5U1

MS4A15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, humanhuman

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Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A15Q8N5U1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
MS4A15Q8N5U1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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MS4A15Q8N5U1 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
MS4A15Q8N5U1 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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