Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NLRP9Q7RTR0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NLRP9Q7RTR0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms