Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC62Q6P9F0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms