Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RTL6Q6ICC9 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RTL6Q6ICC9 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RTL6Q6ICC9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RTL6Q6ICC9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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RTL6Q6ICC9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
RTL6Q6ICC9 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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