Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SLC9A4Q6AI14 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms