Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CCDC93Q567U6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms