Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ACSM3Q53FZ2 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ACSM3Q53FZ2 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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