Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
SP6Q3SY56 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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